La Dra. Lilia Núñez Orozco estudió Medicina en la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) y se graduó en 1974. Realizó el Internado Rotatorio de Posgrado y un año de Medicina Interna en el Centro Médico Nacional “20 de Noviembre” en 1976-77 y  la Residencia de Neurología en el Instituto Nacional de Neurología de la Secretaría de Salud, de 1977 a 1980.

Se incorporó como neuróloga adscrita al servicio de Neurología del Centro Médico Nacional “20 de Noviembre” en 1980 y se convirtió en Jefe del Servicio en 1989.

Es Profesora de Neurología en el Centro Médico Nacional “20 de Noviembre”, curso avalado por la División de Estudios Superiores de la Facultad de Medicina de la UNAM desde 1991. La Dra. Nuñez fue profesora de neurología en la Universidad Panamericana de 2002 a 2011,  profesora de Neurología en la Escuela de Medicina de la Universidad Westhill  de 2002 a la fecha y de la Escuela Superior de Medicina del Institutto Politécnico Nacional desde 2016. Ha sido profesora titular en más de 50 cursos de Educación Médica Continua sobre diferentes tópicos neurológicos y profesora invitada en más de 150 cursos y congresos.

Ha publicado más de 20 capítulos sobre diferentes temas neurológicos en libros de Medicina Interna, Farmacología y Neurología y más de 100 artículos científicos. Es coautora del libro Diagramas de Decisión Médica y editora del libro El manejo integral de los pacientes con esclerosis múltiple (2003) y del libro Epilepsia: una perspectiva clínica (2008), así como del libro La Epilepsia al alcance de todos (2014). Editora Fundadora y Editora en Jefe de la Revista Mexicana de Neurociencia, órgano oficial de la Academia Mexicana de Neurología 1999-2010.

Fue Presidenta de la Academia Mexicana de Neurología en el periodo 2000-2002, Tesorera del Consejo Mexicano de Neurología en el periodo 1998-2004, Presidenta del Consejo Mexicano de Neurología 2004-2006; es miembro activo corresponsal de la American Academy of Neurology desde 1996, Presidenta de la Sociedad Médica del CMN 20 de Noviembre 2007-2009, Presidenta del Capítulo Mexicano del Buró Internacional para la Epilepsia desde 1991 y del Comité Latinaomericano del Buró Internacional para la Epilepsia 2005-2013.

En julio de 2009 recibió el premio Embajadora de la Epilepsia por parte de la Liga Internacional contra la Epilepsia y el Buró Internacional para la Epilepsia. Es Vicepresidenta por Latinoamérica en el Comité Ejecutivo Internacional del Buró Internacional para la Epilepsia 2011-2017. Vicepresidenta de Ciencias neurológicas en la Sociedad Mexicana de Neurología y Psiquiatría 2015-2017.  Maestría en Educación Médica por Competencias, Universidad Westhill, 2015.